ご投稿ありがとうございます。BooT.oneチームです。

ご要望の内容に関しましては、Revit標準機能の[鉄骨]タブ → [パラメトリックの切断]パネル → [留め継ぎ▼] → [のこぎり切断-フランジ][のこぎり切断-Web]ツールをご活用いただけるかと存じます。
ツールクリック後に柱・梁を選択し[Enter]を押下することで、接合部の調整が可能となっておりますので、お試しいただけますと幸いでございます。
ツールのクリック数も多くなく、[Enter]を押下後も繰り返し操作が可能となっております。
詳細につきましては、Autodeskのヘルプ記事等をご参考ください。

上記ツールにてご対応いただけない点等がございましたら、ご意見をご投稿いただけますと幸いでございます。

お世話になっております。
ご提案の作業を試してみましたが、ファミリが悪いのかもしれませんがうまくいきませんでした。
また結局柱と梁を１本ずつ選択する必要がありますし、スラブと柱では機能しないと思います。

やはり最初の投稿のように「切り取るカテゴリと切り取られるカテゴリを指定し、重なっている場合は切り取る」ツールがあればうれしいです。
dynamoでノードを検索しましたが「ジオメトリを切り取り」と同じ動きをするノードも見当たらなかったため、dynamoで一括処理は困難と感じました。
以上、よろしくお願いいたします。

ご投稿ありがとうございます。BooT.oneチームです。

前回ご案内致しました[のこぎり切断-フランジ][のこぎり切断-Web]ツールをご利用いただけない状況は、ファミリの断面形状が定義されていない等のファミリ起因の現象と推察されます。
そのため、可能でございましたら、RevitのデフォルトファミリやBooT.oneの構造部材ファミリをご利用の上、ご対応いただけますと幸いでございます。

なお、連続した切取りの処理に関しましては、RevitのAPIの都合上、対応が難しい状況のため、大変恐れ入りますが、本件は「実装見送り」とさせていただきます。